Registracija vlasničke pozicije s brokerskim društvom je preduvjet za prodaju vrijednosnih papira na tržištu. Njome se brokeru omogućuje upravljanje određenom količinom vrijednosnih papira investitora sukladno nalogu za prodaju koji mu je investitor prethodno izdao, a istovremeno i spriječava investitora da iste dionice ponudi za prodaju posredstvom drugog brokera ili samostalno sklopi ugovor o prodaji. Postupak registracije se odvija na način da broker u sustav Agencije unosi zahtjev za registraciju vlasničke pozicije (temeljem naloga investitora), a investitor taj zahtjev potvrdi. Zahtjev za registraciju dionica može se obaviti putem interneta, osobnim dolaskom ili telefonom. Prilikom telefonske registracije koja je ovih dana bila otežana zbog velikih navala, investitor se identificira PIN-om, a cijeli postupak je automatiziran, bez intervencije operatera Agencije i u normalnim uvjetima traje nekoliko sekundi. Registracija putem interneta može se obaviti tek nakon aktiviranja usluge putem regularne pošte ili osobnim dolaskom na šalter SDA, zbog čega se svima koji planiraju koristiti registraciju putem interneta preporučuje da prouče pravila i podnesu zahtjev za aktiviranje usluge prije nego će im usluga zatrebati.